La domesticación formal de animales distintos a los perros comenzó durante el Neolítico (hace unos 10,000 años), pero existen indicios de interacciones más cercanas desde antes:

• Gatos:
  Los gatos comenzaron a asociarse con los humanos hace unos 9,000 años en el Creciente Fértil, probablemente debido a su utilidad para controlar plagas en graneros. Sin embargo, se cree que estas relaciones eran inicialmente simbióticas más que de domesticación.
• Aves rapaces:
  Existen indicios de que el uso de aves rapaces para la cetrería pudo haberse iniciado hace unos 12,000 años en Asia Central, aunque las pruebas definitivas son posteriores.
• Herbívoros para transporte y producción:
  Los camellos, caballos y bueyes comenzaron a ser domesticados en regiones específicas hace aproximadamente entre 6,000 y 4,000 años, mucho después del vínculo inicial con los perros.

Fue en este periodo –Neolítico- donde se dio lugar a la domesticación de animales que jugaron roles clave en la economía, la supervivencia y la cultura de las primeras comunidades agrícolas. Los animales domesticados durante esta época enlistan:

1. Las cabras (Capra aegagrus hircus) y las ovejas (Ovis aries) que fueron seleccionadas por su carne, leche y lana. Estas especies se domesticaron inicialmente en el Creciente Fértil, una región que abarca partes del actual Irak, Irán, Siria y Turquía.
2. El ganado Bovino: Los bueyes y vacas (Bos taurus) fueron domesticados por su carne, leche y como animales de tiro. El proceso de domesticación de estas especies ocurrió aproximadamente hace 8,000 años. Los Asnos y Bueyes, se usaron para el transporte de cargas y la labor en los campos, haciendo más fácil la producción agrícola
3. Los cerdos, domesticados hace aprox 9.000 años, descienden de los jabalíes salvajes y se adaptaron muy fácil a los humanos por su dieta omnívora y su capacidad para reproducirse rápidamente.